由肺科发展而来，是国内最早建立的肺病学研究室。科室专家们前后在结核病防治和肺功能检测、机械通气用于呼吸衰竭救治、支气管镜介入诊断和内科胸腔镜的操作及规范、无创通气的应用推广及无创面罩的研发、免疫抑制宿主肺部感染的发病机制和诊断治疗、物联网医学的布局和内涵研究上做出了引领性的贡献。此外，密切结合疾病谱变化及我国呼吸科临床需求，形成了呼吸危重症、慢性气道疾病、肺部肿瘤和介入、肺部感染和间质性肺病五大亚专科。学科同时拥有睡眠室，支气管镜室，肺功能室。承担了国家多个重点科研项目；重视教学工作，为全国培养了大量的医学人才；在呼吸道新发传染病的防控上发挥了积极的作用；与国内外企业和医学院校研究机构等建立了长久的合作平台，培养了具有国际视野和转化医师的一批骨干，带动了诊疗技术的提高。